Organi Saveza ratnih vojnih invalida Federacije Bosne i Hercegovine su Skupština, Predsjedništvo i Nadzorni odbor.
Skupština
Najviši organ Saveza. Donosi Statut, program rada i finansijski plan, te bira Predsjedništvo i Nadzorni odbor.
Predsjedništvo
Izvršni organ koji vodi rad Saveza između zasjedanja Skupštine i provodi njene odluke. Čine ga predstavnici kantonalnih saveza.
Nadzorni odbor
Nadzire materijalno-finansijsko poslovanje Saveza i o tome izvještava Skupštinu.